Análisis bioinformático del transcriptoma de progenitores eritroides con delección bialélica del gen Was

Abstract

La línea celular MEL (Murine Erytroleukemia cell line) deriva de proeritroblastos inmortalizados con el SFFV (Spleen Focus Forming Virus), el cual se integra en el locus del Sfpi-1/PU.1, corriente arriba de la región codificante del factor de transcripción de PU.1, lo que resulta en una proliferación descontrolada y el bloqueo de la diferenciación eritroide. A partir de la exposición continua de células MEL al agente inductor HMBA, se estableció la línea celular MEL-R, cuya principal característica es la resistencia a los agentes inductores. En estudios previos, se llevaron a cabo análisis transcriptómicos entre MEL y MEL-R logrando identificar genes diferencialmente expresados, entre los que se encontró un grupo de genes relacionados con la organización del citoesqueleto de actina. Dentro de este grupo destacaron los genes que codifican para la proteína tirosina quinasa de Bruton (BTK) y la proteína del síndrome de Wiskott-Aldrich (WASp), ambas específicas del linaje eritroide y relacionadas a enfermedades hematológicas severas. La pérdida de función de WASp ocasiona marcados defectos en el citoesqueleto de actina y los pacientes con síndrome de Wiskott-Aldrich (SWA) presentan un rango variado de rasgos clínicos que incluyen problemas inflamatorios, inmunodeficiencia, autoinmunidad y, en algunos casos, anemia hemolítica. Si bien el rol de Was está ampliamente estudiado en el linaje linfoide y mieloide, su papel dentro del linaje eritroide todavía se mantiene poco claro. En la presente tesis se llevó a cabo un análisis bioinformático del transcriptoma de células MEL con deleción bialélica de Was, con el fin de estudiar su función en el contexto eritroide y su posible rol en la reprogramación de la diferenciación en células eritroleucémicas. Los resultados de la presente tesis confirmaron que Was es prescindible en la maduración final del linaje eritroide. Además, la ausencia de Was altera la expresión de genes relacionados con la biosíntesis del grupo hemo, apoptosis, metabolismo celular y dianas de oncogenes del linaje eritroide. Por último, nuestros datos también sugieren que la expresión de BTK es necesaria para el correcto funcionamiento de WASp, lo cual podría tener implicancias en el tratamiento de pacientes con SWA.