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dc.contributor.advisorFernández de Nestosa, María José
dc.contributor.authorMartínez Chamorro, Victor Manuel
dc.date.accessioned2022-04-22T23:02:12Z
dc.date.available2022-04-22T23:02:12Z
dc.date.issued2014
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.14066/3097
dc.description.abstractDurante la replicación, las moléculas de DNA sufren cambios topológicos que afectan su superenrollamiento, encadenamiento y anudamiento. Con el fin de entender mejor la función de las enzimas que controlan la topología del DNA durante la replicación, se utilizo un abordaje multidisciplinario con técnicas de biología molecular y simulaciones computacionales para examinar un plásmido bacteriano con sus horquillas replicativas detenidas tras haber replicado el 60% de la molécula. El DNA se aisló y se trató in vitro con dos enzimas topoisomerasas de tipo II: topoisomerasa IV (Topo IV) y DNA girasa. El efecto de estas enzimas sobre la topología de los intermediarios de replicación (RIs) en presencia o ausencia de un agente intercalarte se analizó mediante electroforesis bidimensional en geles de agarosa. Se realizaron simulaciones computacionales basadas en el método de Metropolis Monte Carlo (MC) con el fin de predecir la estabilidad termodinámica de estas moléculas, donde la energía elástica está dada por potenciales cuadráticos dependientes del desplazamiento angular de torsión y de doblado. Los resultados de las simulaciones incluyen la curva de energía potencial en función del índice de ligamiento para determinar la energía potencial que puede ser almacenada en la región no replicada y la curva de energía potencial en función de el número de encadenamiento para obtener la energía que puede ser almacenada en la región ya replicada. Una vez obtenidas las curvas de energía para superenrollamiento y encadenamiento se pudo estimar la conformación más estable para un RI bajo los efectos de ambos fenómenos topológicos. El método desarrollado en la presente tesis podría ser útil para interpretar las señales observadas en geles bidimensionales de agarosa.es
dc.description.sponsorshipCONACYT - Consejo Nacional de Ciencia y Tecnologíaes
dc.language.isospaes
dc.publisherFP-UNAes
dc.subject.classification1303 I+D en relación con las Ciencias médicases
dc.subject.otherTOPOISOMERASAS DE TIPO IIes
dc.subject.otherGENETICA HUMANAes
dc.subject.otherADNes
dc.titleRol de las topoisomerasas de tipo II en la regulación del superenrollamiento y el pre-encadenamiento en intermediarios de replicación de DNAes
dc.typemaster thesises
dc.description.fundingtextPROCIENCIAes
dc.relation.projectCONACYTTES-BN-033es
dc.rights.accessRightsopen accesses
dc.subject.ocdeINVESTIGACION; CIENCIAes
thesis.degree.disciplineIngeniería y Tecnologíaes
thesis.degree.grantorUniversidad Nacional de Asunción - Facultad Politécnica (PY)es
thesis.degree.levelMaestríaes
thesis.degree.nameMaestría en Ciencias de la Computaciónes


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  • Tesis de Maestría
    La colección consiste en las tesis de maestría aprobadas en el marco del instrumento "Creación y fortalecimiento de programas de posgrados académicos" del Programa PROCIENCIA.

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