Análisis de los cambios genéticos como mecanismos utilizados por los rotavirus para persistir en poblaciones humanas

Abstract

Los rotavirus son uno de los patógenos más importantes en humanos y animales. Son virus no envueltos que poseen un genoma compuesto por segmentos de ARN de cadena doble, cada uno de los cuales codifica una proteína. Las dos proteínas de superficie del virión, VP7 y VP4 poseen sitios antigénicos contra los cuales se producen los anticuerpos neutralizantes. Históricamente la clasificación de los rotavirus estaba basada en la secuencias de los genes que codifican las dos proteínas de superficie. El actual sistema de clasificación se basa en el análisis de la secuencia entera del genoma de rotavirus, donde Gx-P[x]-Ix-Rx-Cx-Mx-Ax-Nx-Tx-Ex-Hx designa los genotipos para los genes VP7-VP4-VP6-VP1-VP2-VP3-NSP1-NSP2-NSP3-NSP4-NSP5 respectivamente. Este sistema de clasificación permitió determinar la compleja interacción entre las cepas humanas y animales y que los rotavirus mantienen constelaciones génicas definidas. En nuestro laboratorio poseemos una colección de más de 700 muestras tipificadas de rotavirus durante los años 1998-2009 que nos permitió estudiar la dinámica de los rotavirus en una población no vacunada. En base a las variaciones en la dominancia de un determinado genotipo y la composición de su genoma, podemos proponer que la capacidad de un genotipo determinado de rotavirus de predominar sobre otros, no es sólo el producto de cambios antigénicos en las proteínas VP7 y/o VP4, sino es más bien debido a la introducción de una nueva constelación génica. Esto pudiera sugerir que tanto combinaciones génicas óptimas para formar el virión, el rol que juegan otras proteínas en la respuesta inmune, así como el estatus inmunológico de una población, son determinantes en la dinámica epidemiológica de los rotavirus.